Монография «Практическая функциональная митохондриология» является новой версией книги «Практическая митохондриология», в которой автор рассказал о своем опыте выделения митохондрий из разных органов и решения проблем, возникающих в ходе экспериментов. Поскольку книга основана на личном экспериментальном опыте автора, приводимые в ней данные и теоретические гипотезы являются новыми и впервые публикуются в последовательном изложении. Еще в конце XX в. и в начале XXI стало понятно, что существующие методы исследования митохондрий неприемлемы для изучения функций митохондрий с позиций физиологии и патофизиологии. Главные недостатки методов были связаны прежде всего с неправильным подбором субстратов. Для понимания новой методологии изучения функций митохондрий в первых главах дается описание с позиций новых парадигм основных функций митохондрий: дыхания, окислительного фосфорилирования и транспорта ионов кальция. Эти парадигмы следующие: 1) все метаболические процессы в митохондриях нужно рассматривать в рамках законов неравновесной термодинамики; 2) митохондрии окисляют одновременно не один, а несколько субстратов; 3) функции митохондрий тесно связаны с функциями органа, в клетках которого они находятся; 4) сукцинатдегидрогеназа (СДГ) является ключевым ферментом контроля метаболизма, а наличие и степень выраженности эндогенного торможения СДГ определяет метаболический фенотип органа и животного; 5) жирные кислоты являются главным источником энергии в организме, и особенности окисления жирных кислот являются причиной гендерных различий в метаболизме и продолжительности жизни мужчин и женщин; 6) изменения митохондриального метаболизма с возрастом, то есть в ходе постэмбрионального онтогенеза, являются причиной старения и многих возрастных патологических процессов человека.