Издательство СО РАН

Издательство СО РАН

Адрес Издательства СО РАН: Россия, 630090, а/я 187
Новосибирск, Морской пр., 2

soran2.gif

Baner_Nauka_Sibiri.jpg


Яндекс.Метрика

Поиск по журналу

Теплофизика и аэромеханика

2016 год, номер 6

К гидродинамической интерпретации процесса укладки α-спирального белка

В.А. Андрющенко1,2, С.Ф. Чекмарев1,2
1Институт теплофизики им. С.С. Кутателадзе СО РАН, Новосибирск
chekmarev@itp.nsc.ru
2Новосибирский государственный университет, Новосибирск
Ключевые слова: α-спиральный белок, процесс укладки, потоки укладки, турбулентность
Страницы: 979-982

Аннотация

С использованием метода молекулярной динамики проведено моделирование укладки белка в виде α-спиральной шпильки из развернутого состояния в компактное функциональное (нативное) состояние. Процесс укладки интерпретируется как стационарное движение сжимаемой «жидкости укладки». Показано, что плотности потоков укладки подчиняются тем же соотношениям подобия, что и скорости несжимаемой жидкости в классической теории турбулентности Колмогорова, с той разницей, что роль ключевого параметра, представляющего собой скорость изменения кинетической энергии на единицу массы жидкости, играет скорость изменения дисперсии потоков на единицу объема.