ISSR-АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА ПРИРОДНОЙ И ИНТРОДУКЦИОННОЙ ПОПУЛЯЦИЙ SAPOSHNIKOVIA DIVARICATA (APIACEAE)
Т.Э. Скворцова, Т.В. Елисафенко, И.Н. Кубан, В.Н. Якк, О.В. Дорогина
Центральный сибирский ботанический сад СО РАН, Золотодолинская, Россия tataskvo@gmail.com
Ключевые слова: Apiaceae, Saposhnikovia divaricata, природная популяция, интродукция, ISSR-ПЦР, генетическое разнообразие, внутрипопуляционная и межпопуляционная изменчивость, Республика Бурятия
Страницы: 238-247
Аннотация
Вид Saposhnikovia divaricata (Turcz.) Schischk. является эндемиком юго-восточной Азии. В корнях растений обнаружены биологически активные вещества, используемые в фармацевтике и косметологии. В связи с этим, отмечено массовое и нерегулируемое изъятие S. divaricata из растительных сообществ, что может приводить к нарушению баланса генов в ценопопуляциях этого вида. Оценка генетической изменчивости в природных популяциях и разработка технологии выращивания S. divaricata является актуальной задачей. В данном исследовании определен оптимальный протокол проведения ISSR-ПЦР для S. divaricata, выбраны наиболее информативные праймеры, подобраны условия для их эффективной амплификации, проведен сравнительный анализ генетического полиморфизма ценопопуляции и интродуцентов 3-го поколения. Нами изучено 16 образцов, собранных в природной популяции в Республике Бурятия и 15 образцов интродуцентов, выращенных на экспозиции “Редкие и исчезающие виды растений Сибири” Центрального сибирского ботанического сада СО РАН (г. Новосибирск). Из протестированных 17 ISSR-праймеров отобраны 4 информативных для S. divaricata, которые использовали для сравнительного анализа генетической изменчивости. В результате определены генетические дистанции, уровень полиморфизма, внутри- и межпопуляционная изменчивость. Нами выявлено 114 ПЦР-фрагментов длиной от 220 до 3000 п.н., 108 из которых были полиморфными (процент полиморфизма праймеров - 94.7 %). При использовании различных статистических программ (TREECON 1.3b, GenALEx 6.51) установлено, что как природная популяция S. divaricata, так и интродуценты характеризуются умеренной генетической изменчивостью: информационный индекс Шеннона - 0.48 ± 0.02 и 0.49 ± 0.02 соответственно; процент полиморфных локусов - 89 и 88 соответственно. Нами установлено, что методика ISSR-ПЦР может быть успешно использована для генетического анализа морфологически близких популяций S. divaricata. Для быстрого скрининга достаточно использовать один из четырех маркеров (HB12, НВ14, 17899A, 17899B), которые показали высокую эффективность. В результате проведенного исследования установлено, что генетическое разнообразие S. divaricata существенно не изменилось в условиях интродукции при смене поколений по сравнению с исходной природной популяцией .
DOI: 10.15372/RMAR20250304 |